[...] oder ich müsste den Text, den ich in JS vorliegen habe, auch irgendwie umgewandelt bekommen.
Entweder du schreibst statt z.b.
suchwort = 'abç'
suchwort = 'ab'+String.fromCharCode(231)
oder du schreibst das Suchwort per innerHTML
in ein HTML-Element und ließt es anschließend wieder aus.
MfG
der Frank