Habe zwar (nur) Ubuntu aber das dürfte sich nicht so unterscheiden.
Schau mal hier. http://wiki.ubuntuusers.de/AllTray?highlight=(alltray)
Klappt eigentlich wunderbar. Natürlich besser mit der Konsole die angegebenen Datei erstellen und sie ausführbar machen und dann über Einstellungen - ? - Sitzungen in den Startup eintragen.