das xampp-upgrade installieren (http://www.apachefriends.org/download.php?xampp-win32-upgrade-1.6.3-1.6.4-installer.exe). das verändert deine conf-dateien normalerweise nicht.
zur sicherheit vielleicht die php.ini umbenennen und nach dem update wieder zurück-umbenennen. es gibt in der php.in seit 5.2 ein paar neue parameter, aber die sind nicht so lebensnotwendig (guckst du hier: http://www.phpcenter.de/de-html-manual/ini.html).