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Hi Steffen,
Das zu erklären sprengt in jedem Fall den Rahmen des Forums.
Schau mal hier nach, oberste Links (AVR-Tutorial)
http://www.mikrocontroller.net/
Viele Grüsse gary
PS.: Empfehlen kann ich ISP-Methode für den Platinenaufbau (In System Programming). Das spart zusätzliche Servicebuchsen bzw. der Chip muss zum Programmieren nicht aus der Schaltung herausgenommen werden.