Hallo,
ein ganz anderes Problem in dieser Hinsicht: Firefox grösser 2.0 erlaubt focus und blur nur wenn der Benutzer dies in den Voreinstellungen angegeben hat.
Zum eigentlichen Problem: Willst du das Fenster in den Vordergrund bringen, oder willst du es schliessen (in der Überschrift steht schliessen, im Post dann aber focus)?
Hast du schon die einfachste Variante versucht:
windowNeu.focus();
nachdem du das Fenster erzeugt hast? Zumindest im IE müsste das auf jeden Fall gehen.