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"Und welche Unterschiede bestehen zwischen der initialen Befüllung und den Updates?"
Keiner, ausser dass in der alten Tabelle durchaus auch mal neue Datensätze dazukommen können, die dann wieder per INSERT in die Neue eingefügt werden müssen.
Wie gesagt ist die 'neue' Datenbank komplett anders strukturiert, kein einziges Feld gleicht dem der 'alten' Datenbank