Moin!
Es sollte möglich sein, phpmyadmin auf Server A und mySQL auf Server B laufen zu lassen.
Geht prima. So lange die Datenbank den Zugriff zu lässt.
Auch kann man mehrere Benutzer anlegen, siehe Dokumentation.
Lege einfach für jede Datenbank eine Konfiguration ($cfg['Servers'][0], ... $cfg['Servers'][4]) an, das Geheimnis verbirgt dann nur noch sich hinter:
$cfg['Servers'][$i]['controluser'] = "string";
$cfg['Servers'][$i]['controlpass'] string = "string";
zusammen mit:
$auth_type = 'config';
MFFG (Mit freundlich- friedfertigem Grinsen)
fastix