Irgendwie komm ich nicht dahinter, wie ich 2 Orte abfragen kann.
Das ist kein Cool-URI-Problem sondern vermutlich ein Problem mit "was auch immer die Orte sucht".
der parameter sollte nicht city heissen sondern meinetwegen tx_ortesuche_pi1[city] und id sollte nicht id heissen sondern tx_ortesuche_pi1[id]
bei mehreren Orten könnte es tx_ortesuche_pi1[city][] und tx_ortesuche_pi1[id][] sein - oder aber auch etwas ganz anders.
Dein Problem liegt in erster Linie bei der falschen Nutzung der TYPO3-API und in zweiter Linie bei der Suche an der falschen Stelle.