document.getElementById('iframe').scrollBy(100,100); // horizontal and vertical scroll increments
getElementById liefert dir ein iframe-Elementobjekt,
scrollBy ist eine Methode des window-Objekts des Iframes,
vom dem einen auf das andere kommst du über die contentWindow-Eigenschaft des iframe-Elements.
document.getElementById('iframe').contentWindow.scrollBy(100,100);
Eine andere Möglichkeit wäre window.frames:
frames.iframe.scrollBy(100,100);
Mathias