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Hallo,
Was spricht denn "top" so? Vielleicht findest Du da einen Prozess der Dir Anhaltspunkte bietet.
Ansonsten fiele mir noch ein, dass ggf. die 3D-Beschleunigung nicht richtig will, und deshalb alles mit Software-Rendering gemacht wird. Wenn Du irgendwelche abgefahrenen Effekte in Ubuntu aktiviert hast, kann das dann ziemlich die Performance in den Keller treiben.
Memory ist bei meinem System (Kubuntu) übrigens auch ähnlich ausgelastet.
Viele Grüße,
Jörg
Der Martin