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Ganz ehrlich? Ich weiß nicht, was du mit der polemischen Aussage vom Glaskugellesen bezwecken möchtest.
Ich brauche schlicht eine Auskunft darüber, ob eine mysql-Datenbank ohne Einflußnahme über php-scripte Daten verlieren kann- z.B. durch sowetwas wie Fragmentierung.
Nein, ist nicht möglich wenn alles was du erzählt hast tatsächlich stimmt.
Hilft dir das jetzt? Nicht? Deshalb die polemische Aussage übers Glaskugellesen, wir können dir so schlicht nicht helfen.
Läuft der Webserver auf Produktion? Wer hat Zugang zu diesem Server? Gibts da möglicherweise Kleingeister die willkürlich versuchen Daten zu löschen? Hast du dich gegen solche Angriffe geschützt (MySQL-Injections)? Verwendest du phpMyAdmin und ist dieses "von aussen" zugänglich?
Ich verstehe durchaus dass du keine Ahnung hast was das Problem verursachen könnte, auch dass du in einem Forum nach Hilfe suchst, aber wie sollen wir mit so wenigen Hintergrundinformationen irgendwas sehen auf das du selbst noch nicht gestossen bist?