Wie kann ich direkt oder indirekt verhindern, dass diese Meldung kommt? Weil müsste ja dann auf NEIN klicken damit es weiter läuft.
Der IE10 unterstützt Websockets, also echtes Mulithreading für Javascript.
Ansonsten versuche Performace-Probleme in deinem Code zu finden und ggf. zu optimieren oder du lagerst den Code auf den Webserver aus.