Ja, starte einfach das Programm als root. sudo ist das probate Mittel dafür. Eine andere Möglichkeit ist, das Setuid-Bit auf der auszuführenden Datei zu setzen (nicht empfohlen).
Das alles sind Unixgrundlagen. Bitte mache dich mit der Systemprogrammierung auf C-Ebene bezüglich Benutzer/Gruppen vertraut, ein geeigneter Einstiegspunkt ist http://enwp.org/Setuid.
PS: Taintcheck für sicherheitskritische Programme ist Pflicht. Benutze immer -T im Shebang/Kommandozeile.