Weil das Verhalten vorne und hinten nicht auf das visuelle Feedback passt – ja. Drei Tabellen zu kopieren und dabei eine wieder einzufügen widerspricht dem, was man als Nutzer erwartet. Der Nutzer weiß nicht, dass es sich im technischen Sinne um nur eine Tabelle handelt. Er weiß übrigens auch nicht, warum er die Kopfzeilen nicht markieren kann.
Naja, ein ähnliches Problem hat man doch auch, wenn man THEAD, TFOOT, TBODY verwendet: Da muss man im Quellcode auch (unverständlicherweise) den Footer for dem Body aufführen und wenn man die Tabelle in die Zwischenablage kopiert landet es in der gleichen Reihenfolge dort, obwohl der Browser es anders darstellt.