Ja. Der (vorwiegend) gleiche Inhalt unter verschiedenen URIs wird als Duplicate Content gewertet. Ausnahmen davon gibt es aber auch, wie z.B. die gleiche Ressource, die mit verschiedenen Protokollen erreichbar ist.
Du meinst http://example.org/ressource vs https://example.org/ressource? Warum sollte das kein Duplikate Content sein?