Tach!
Bring Deinen Code dazu daß er Fehlermeldungen ausgibt wenn Zugriffe auf Dateien fehlschlagen. Oder allgemeiner ausgedrückt: Den Layer der für die Persistierung zuständig ist.
Du bist da auf dem falschen Dampfer unterwegs. Es ist kein Fehler sondern ein Feature von H2, dass man es persistierend und nicht-persistierend verwenden kann. Es ging hier lediglich darum, wie man dem H2 erzählt, gemäß welcher der beiden Formen es arbeiten soll.
dedlfix.