Man kann kein Downgrade von auf das alte MySQL 5.5 durchführen in dem man das Verzeichnis und ergo die binären Dateien - ganz gleich ob im MyISAM oder InnoDB-Format - kopiert.
Bei Upgrades mag das womöglich in manchen Fällen gehen (mit dem entsprechenden Update/Repair-Skript) aber nicht bei Downgrades.
Schon für das (störungsfreie) Wiedereinlesen eines Dumps gibt es bei einem Downgrade keine Garantie, da kann erhebliche Mehrarbeit durch Editieren des Dumps erforderlich werden.