Hallo TS,
Baum per symbilic Link eingebunden
Aber das könnte der Entscheidende Hinweis™️ sein.
Wenn das dein Konstrukt ist:
/foo
   /bar
      .htaccess
      /testDir (link to /baz/moo/testDir)
/baz
   /moo
      /testDir (real)
         .htaccess
und der Server bei einem Indexabruf von testDir nach der .htaccess Datei der Elternverzeichnisse sucht, besteht dann die Möglichkeit, dass er in /baz/moo und /baz sucht, aber nicht in /foo/bar und /foo.
Rolf
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sumpsi - posui - obstruxi
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