Hallo,
mach doch einfach eine zweite funktion oder besser eine funktion mit parameterübergabe...
function PopupFenster(seite) {
F = window.open(seite,"Popup","width=565,height=255,left=200,top=50");
}
<a href="javascript:PopupFenster("datei.html");">öffnen</a>
du könntest auch noch einen weiteren parameter anbasteln(mit Komma trennen), damit sich auch zwei verschiedene fenster öffnen, da es immer wieder überschrieben wird, solange es den gleichen namen hat...
Odium