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Einen GB davor möchte ich für den Datenaustausch mit eXPerience
Auf den kannst du verzichten. Von Linux aus kannst du NTFS lesen und FAT schreiblesen. Von Windows aus kannst du ext2/3 und reiserfs lesen, z.B. mit http://ghisler.com/dplugins.htm#dateisys. Damit ist der Datenaustausch also bereits in beide Richtungen gewährleistet, je nachdem, in welchem OS du dich gerade befindest.
Ich habe mit Suse in einer erweiterten Partition hinter Win98 in der ersten primären Partition nur positive Erfahrungen gemacht. Ich habe lilo im MBR der Festplatte installiert, weil der Bootmanager von Windows nur Windows bootet.