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Wie berechnest du denn die Position der absoluten Elemente (Drop-Down-Menüs) ?
Abgesehen davon, wieso benutz du iFrames ?
Das dürfte zwar nicht mit dem Problem zusammenhängen, aber ich finde das ist hier nur eine weitere Quelle der Inkompatibilität.
Habe selber ein mehrstufiges Drop-Down-Menü entwickelt, daß auf allen Browsern gleichermassen gut funktioniert (siehe die Galerie-Auswahl im www.forum35.de).
Wenn es dir weiterhilft, dann kriegst du hier den entscheidenten Code zum Berechnen der Position der absoluten Elemente.