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Und wo muss/kann/soll ich dann noch Indexes setzen?
Erst einmal gar nicht, setz die Primaer- und Fremdschluessel und sei happy. Wenn es dann bei bestimmten Abfragen messbare, also echte Performance-Engpaesse gibt, dann frag noch mal nach oder lies Dir einfach was zu Indizes und Volltext-Indizes an.