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Kommt darauf an... Wenn deine Inhalte in einer Datenbank liegen, dann ist es einfach. Du verbindest einfach zur Datenbank und bist quasi schon am Ziel.
Wenn du die Dokumente selbst bearbeiten möchtest, dann muss dein Programm über FTP arbeiten. Die Dokumente müssen dann halt vor beginn geholt und anschließend geschickt werden.
Oder verstehe ich dich falsch mit "alle Interaktionen die ich über einen Webbrowser machen kann"? Wenn du einen Browser auf deinem Rechner installiert hast, kannst du diesen auch einfach in deine Software einbinden.
Zu beiden Zwecken gibt es gute und viele Bibliotheken für C#, Java, was auch immer.