Hi,
Jedoch bleibt die Anwendung jedesmal beim generieren der Dateien stehen bzw. wird vom Webserver aufgehalten.
Bitte definiere mindestens das (technisch) genauer.
Ohne bessere Info, was du da mit deiner Anwendung treibst (Sourcecode wäre z.b. hilfreich) kann dir wohl keiner helfen. Stell dir einfach vor, du redest über das Problem mit einem Blinden. ;)
Was meinst du mit "lokalen Rechner"?
ASP.Net kann selbst nichts auf einem Client-Rechner erstellen. Du kannst mit XBAPPS (Extended Browser Applications) oder Silverlight .net code beim Client zur Ausführung bringen, das läuft dann aber mit beschränkten Möglichkeiten/Rechten in Sandboxen.
Genereller Tip: Benutze Tracing und Logging, z.b. log4net um deiner Anwendung zu folgen.
Ciao, Frank