Hi Chris!
Leider wird mir nicht ganz klar, was du nun planst, aber folgendes wäre anzumerken:
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Kunde will einen "Seitenentfaltungseffekt": Leg ihm doch den wachsenden Baum als animated GIF in den Seitenhintergrund.
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Menü: Das Menü sollte ohne Javascript bedienbar sein - und Popups sind eigentlich nicht wünschenswert. Wenn du aber ein Fenster öffnen mußt, dann erreichst du das auch mit html: http://de.selfhtml.org/html/verweise/definieren.htm#zielfenster
Grüsse,
Richard