lichtheini: Dateien eines Verzeichnises hochladen

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Ich denke der FPT Vorschlag ist für die meisten user nicht verständlich genug.

Nein, die User sollten auch nicht unbegrenzten FTP-Zugang haben.

Sonst noch Ideen bzw, gibt es einen Mechanismus, mit dem der User wenigstens mehrere Dateien auswählen kann?

Tatsächlich scheint HTML5 soetwas zu spezifizieren. Das input-Element bekommt dann einfach ein Attribut multiple="multiple".
Laut Tabelle beherrschen das einige Browser. Diese Demo hat in Chrome ohne Flash funktioniert. Ob das angebotene jQuery-Pugin deinen Anforderungen entspricht, musst du selbst wissen (Lizenz, Javascript deaktiviert).
Grüße
der lichtheini