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Ich glaube auch nicht, das Gentoo dafür vorgesehen ist, das es sich in einem chroot installiert, das müßtest Du händisch machen. Also erstmal alle Dev-Tools statisch gelinkt bauen und in's chroot rüberkopieren, da der Gentoo-GCC ja nicht funktioniert, wie Du sagtest. Dann kannst Du mit denen dann Deine Pakete im chroot selber bauen.
Dochdoch, dass ist bei Gentoo so vorgesehen. Dafür gibt es die Stage-Archive, die man in den chroot entpackt; danach wechselt man dann wirklich ins chroot und arbeitet dort mit einem vorkonfigurierten Mini-Basis-System weiter. Wobei bei Stage1 dann doch wieder alles neu gebaut wird.
Und ja, bei Gentoo _muss_ man alles von Hand machen. Siehe auch http://www.gentoo.org/doc/en/handbook/2005.0/handbook-x86.xml