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Applikationen kannst du auch aus Google Play wiederherstellen, da brauchst du nicht umständlich mit Verschieben und Kopieren zu hantieren.
Auch die Daten?
Apps die man nicht über Google Play geladen hat, kann man von dort auch nicht wiederherstellen :)
Aber der OP will sicher auch die aufgrund seiner Handlungen von den Apps generierten Daten sichern [...]
Die liegen, wenn die App von SD-Card (oder zusätzlichem internen Speicher - wie du richtig sagst) läuft unter sdcard/Andorid/data/com.*